今天凌晨，谷歌终于开源了万众期待的卵白质瞻望模子——AlphaFold-3！

上个月，谷歌DeepMind并吞首创东谈主兼首席推论官Demis Hassabis能拿下诺贝尔化学奖，靠的即是AlphaFold-3，足以看出这个模子的含金量。

大众顶级科学期刊《Nature》也进行了重磅保举，这将对大众科研范围产生紧要影响，生物、化学、医药的科学家们不错在土产货部署AlphaFold-3，不错极限镌汰新药、疫苗等研发程度。

齐说AI造福全东谈主类，而医药、科研两大范围即是最蹙迫的应用场景之一，这亦然为什么AlphaFold-3能得回诺贝尔奖的原因。

网友们见到这个模子开源，平直忍不住爆粗口了！

AlphaFold-3能开源，可太Amazing了。

太棒了。迫不足待思看到更高水平的生物模拟。

谷歌伟大的举措。迫不足待思望望这会对生命科学产生什么影响。

令东谈主难以置信的音问！AlphaFold-3的开源可能会成为科学发现的颠覆者。迫不足待思看到它在卵白质照顾中引发的冲突！

谷歌能共享这个太棒了！这果真能接济生命。

谷歌本次开源AlphaFold-3模子杰出杰出低调，致使齐莫得发布一篇新闻，仅仅在本来著述上进行了一段很小的笔墨讲解：

2024年11月11日更新，咱们已发布了AlphaFold 3的模子代码和权重供学术用途，以匡助鼓舞科学照顾。

AlphaFold-3的主邀功能包括，简略对多种生物分子的结构进行瞻望，涵盖卵白质、核酸（包括 DNA 和 RNA）、小分子、离子以及修饰残基等险些通盘在卵白质数据库（PDB）中存在的分子类型。

在卵白质结构瞻望方面，AlphaFold 3 展现出了极高的准确率，在瞻望卵白质单体结构时，简略准确地详情卵白质的三维折叠边幅，包括二级结构α - 螺旋、β - 折叠等精确位置和走向，以及三级结构中各个结构域的相对位置和取向。

AlphaFold 3 在处理复杂结构方面推崇出色，简略大意具有多数残基和多种分子组成的生物分子复合物。举例，在瞻望由数千个残基组成的卵白质 - 核酸复合物结构时，它不错灵验地整合卵白质和核酸分子的信息，准确地构建出通盘复合物的三维结构模子。

关于具有高度对称性或重迭结构单位的复合物，如核小体等，AlphaFold 3 也简略准确地捕捉到其结构特征，包括组卵白与 DNA 的相互作用、核小体之间的罗列边幅等。

在药物研发范围，AlphaFold 3不错匡助照顾东谈主员快速筛选潜在的药物靶点，通过瞻望靶点卵白的结构，揭示其可能的活性位点和结合口袋，为药物筹算提供蹙迫的结构基础。

在药物分子筹算阶段，AlphaFold 3 简略瞻望药物分子与靶点卵白的结合样式，评估药物分子的亲和力和特异性，从而引导药亏欠学家进行分子优化，提高药物的疗效和安全性。

同期不错对药物分子与靶点卵白复合物结构的准确瞻望，匡助照顾东谈主员相识药物作用机制，瞻望药物的反作用和耐药性机制，为药物研发的各个阶段提供枢纽的结构信息扶直。

模子架构方面，AlphaFold 3在AlphaFold 2的基础之上进行了紧要更新。尤其是引入了Pairformer模块替代原有的Evoformer模块，AlphaFold 3权贵减少了多重序列比对（MSA）的处理量，使得模子简略愈加专注于学习分子间相互作用的枢纽特征。

这一变化不仅提高了计较后果，更蹙迫的是，它赋予了模子更强的泛化才气，使得AlphaFold 3简略在处理种种生物分子时齐能保捏高水平的准确性。

AlphaFold 3还通过引入扩散模块，平直瞻望原子坐目的立异筹算，进一步增强了模子的功能。传统的结构瞻望法式时时依赖于氨基酸特定框架或侧链扭转角来进行瞻望，这在一定程度上适度了模子处理不同分子类型的才气。而AlphaFold 3的扩散模块平直操作于原子坐标层面，采纳了一种愈加直不雅且物理上更为合理的建模边幅。

这种法式不仅简化了模子架构，幸免了对复杂规章的依赖，还使得AlphaFold 3简略无缝处理多样类型的生物分子，岂论是卵白质、DNA、RNA依然小分子配体，齐能提供精确的结构瞻望扫尾。

此外，AlphaFold 3在检会法式上也进行了蹙迫的改良。通过采纳跨蒸馏技能，AlphaFold 3简略诓骗由AlphaFold-Multimer v.2.3等高性能模子生成的大范围伪标签数据进行检会。这种计谋不仅处置了高质地检会数据不足的问题，还进一步普及了模子的鲁棒性和泛化才气。

经过这么的检会经由后，AlphaFold 3不仅在法式测试集上推崇出色，还能很好地大意那些荒漠或复杂的生物分子复合体结构瞻望任务，露出出其纷乱的稳健性和可靠性。

现实扫尾标明，经过这么的检会经由后，AlphaFold 3不仅在法式测试集上推崇出色，还能很好地大意那些荒漠或复杂的生物分子复合体结构瞻望任务，露出出其纷乱的稳健性和可靠性。

开源地址：https://github.com/google-deepmind/alphafold3

著述着手：AIGC盛开社区，原文标题：《王炸开源！谷歌开源诺奖化学模子Alphafold-3，整夜编削寰球！》